稍稍整理一下仁兄的提問，以利讀者閱讀：
> 我大略的看了一下玄奘法師譯藥師如來本願功德經，至少阿難是信
> 佛所說的，反倒沒有佛罵阿難的講法，加上印象中，
> 有時佛問阿難信不信這話時，阿難總會說佛說的他不生疑惑等等，所以
> 才把灌頂經最後一卷的部分貼出，想問問這部分是不是被潤飾的部分？
《佛說灌頂經》第十二卷：
http://www.cbeta.org/result/normal/T21/1331_012.htm
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佛說是語時，阿難在右邊，佛顧語阿難言：「汝信我為文殊師利
說往昔東方過十恒河沙有佛名藥師琉璃光本願功德者不？」
阿難白佛言：「唯天中天佛之所說何敢不信耶？」
佛復語阿難言：「其世間人雖有眼耳鼻舌身意，人常用是六事以自
迷惑，但信世間魔邪魔之言，不信至真至誠度世苦切之語，如是輩人難
可開化也。」
阿難白佛言：「世尊，世人多有惡逆下賤之者，若聞佛說，經開人
耳目破治人病，除人陰冥使光明，解人疑結去人重罪，千劫萬劫無復憂
患，皆因佛說是藥師琉璃光佛本願功德，悉令安隱得其福也。」
佛言：「阿難，汝口為言善，而汝內心狐疑不信我言；阿難，汝莫
作是念，以自毀敗汝之功德。」
佛言：「阿難，我見汝心，我知汝意，汝知之不？」
阿難即以頭面著地長跪，白佛言：「審如天中天所說，我造次聞佛
說是藥師琉璃光極大尊貴，智慧巍巍難可度量，我心有小疑耳，敢不首
伏。」
佛言：「汝智慧狹劣少見少聞，汝聞我說深妙之法無上空義，應生
信敬貴重之心。必當得至無上正真道也。」
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唐玄奘版本藥師如來本願功德經：
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爾時世尊告阿難言。如我稱揚彼佛世尊藥師琉璃光如來所有功德。此是諸佛
甚深行處難可解了。汝為信不。
阿難白言。大德世尊。我於如來所說契經不生疑惑。所以者何。一切如來身
語意業無不清淨。世尊。此日月輪可令墮落妙高山王可使傾動。諸佛所言無
有異也。
世尊。有諸眾生信根不具。聞說諸佛甚深行處。作是思惟。云何但念藥師琉
璃光如來一佛名號便獲爾所功德勝利。由此不信反生誹謗。彼於長夜失大利
樂墮諸惡趣流轉無窮。
佛告阿難。是諸有情。若聞世尊藥師琉璃光如來名號。至心受持不生疑惑。
墮惡趣者無有是處。阿難。此是諸佛甚深所行難可信解。汝今能受。當知皆
是如來威力。
阿難。一切聲聞獨覺及未登地諸菩薩等。皆悉不能如實信解。惟除一生所繫
菩薩。阿難。人身難得。於三寶中信敬尊重亦難可得。得聞世尊藥師琉璃光
如來名號復難於是。阿難。彼藥師琉璃光如來無量菩薩行。無量善巧方便。
無量廣大願。我若一劫若一劫餘而廣說者。劫可速盡。彼佛行願善巧方便無
有盡也。
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佛光注照本命元辰，災星退度，福星臨；九曜保長生，運限和平，福壽永康寧。
南無藥師琉璃光如來。明珠照徹天堂路，金錫振開地獄門。南無大願地藏王菩薩。
人如少水魚，斯有何樂？南無大行普賢王菩薩。
千處祈求千處應，苦海常作度人舟。南無大慈大悲觀世音菩薩。
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