(一)如來證悟了義之果德名祕密藏，而達到此祕密藏之因行，稱為密因。密，乃經上所說之陀羅尼，非凡小所能知，故稱密，密即因。楞嚴義疏卷八之二（大三九‧九三三上）：「三世果人入祕密藏，以此為因，密之因也。又此大定具一切行，而非凡小之所能知，故名為密。密即因也。」〔首楞嚴經序、大日經卷五〕
(二)指佛菩薩之本地。楞嚴義疏卷六之二（大三九‧九一四下）：「真聖利物，終不可測，以承佛制，不妄漏泄，此聖真因，唯聖自證，故云密因。」〔首楞嚴經卷六〕 p4475